Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPA1P15085 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPA1P15085 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPA1P15085 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPA1P15085 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CPA1P15085 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPA1P15085 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPA1P15085 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CPA1P15085 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CPA1P15085 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPA1P15085 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPA1P15085 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPA1P15085 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPA1P15085 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPA1P15085 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPA1P15085 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPA1P15085 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPA1P15085 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPA1P15085 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPA1P15085 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPA1P15085 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPA1P15085 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPA1P15085 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CPA1P15085 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPA1P15085 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPA1P15085 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPA1P15085 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPA1P15085 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPA1P15085 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPA1P15085 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPA1P15085 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPA1P15085 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPA1P15085 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPA1P15085 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPA1P15085 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPA1P15085 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPA1P15085 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPA1P15085 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPA1P15085 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPA1P15085 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPA1P15085 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPA1P15085 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPA1P15085 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPA1P15085 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPA1P15085 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPA1P15085 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPA1P15085 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPA1P15085 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPA1P15085 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPA1P15085 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPA1P15085 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPA1P15085 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPA1P15085 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPA1P15085 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPA1P15085 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPA1P15085 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPA1P15085 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPA1P15085 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPA1P15085 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CPA1P15085 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CPA1P15085 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CPA1P15085 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CPA1P15085 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CPA1P15085 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CPA1P15085 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CPA1P15085 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CPA1P15085 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPA1P15085 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPA1P15085 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CPA1P15085 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPA1P15085 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPA1P15085 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPA1P15085 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPA1P15085 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CPA1P15085 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPA1P15085 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPA1P15085 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPA1P15085 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPA1P15085 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPA1P15085 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPA1P15085 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPA1P15085 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPA1P15085 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPA1P15085 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPA1P15085 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPA1P15085 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPA1P15085 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPA1P15085 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPA1P15085 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPA1P15085 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPA1P15085 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPA1P15085 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPA1P15085 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPA1P15085 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPA1P15085 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPA1P15085 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPA1P15085 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPA1P15085 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPA1P15085 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPA1P15085 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms