Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2F2P13984 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms