Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC5A1P13866 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC5A1P13866 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC5A1P13866 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms