Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLS3P13797 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLS3P13797 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLS3P13797 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLS3P13797 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLS3P13797 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLS3P13797 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PLS3P13797 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLS3P13797 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLS3P13797 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLS3P13797 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLS3P13797 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLS3P13797 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLS3P13797 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLS3P13797 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLS3P13797 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLS3P13797 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLS3P13797 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLS3P13797 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLS3P13797 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLS3P13797 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLS3P13797 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLS3P13797 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLS3P13797 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLS3P13797 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLS3P13797 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLS3P13797 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLS3P13797 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLS3P13797 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLS3P13797 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLS3P13797 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLS3P13797 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLS3P13797 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLS3P13797 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLS3P13797 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLS3P13797 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLS3P13797 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLS3P13797 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLS3P13797 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLS3P13797 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLS3P13797 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PLS3P13797 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLS3P13797 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLS3P13797 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PLS3P13797 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLS3P13797 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLS3P13797 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLS3P13797 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLS3P13797 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLS3P13797 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLS3P13797 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLS3P13797 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLS3P13797 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLS3P13797 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLS3P13797 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLS3P13797 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLS3P13797 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLS3P13797 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLS3P13797 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLS3P13797 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLS3P13797 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLS3P13797 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLS3P13797 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLS3P13797 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLS3P13797 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLS3P13797 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLS3P13797 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLS3P13797 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLS3P13797 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PLS3P13797 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLS3P13797 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLS3P13797 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLS3P13797 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLS3P13797 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLS3P13797 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLS3P13797 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLS3P13797 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLS3P13797 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLS3P13797 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLS3P13797 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLS3P13797 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLS3P13797 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLS3P13797 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLS3P13797 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PLS3P13797 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLS3P13797 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLS3P13797 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLS3P13797 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLS3P13797 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLS3P13797 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLS3P13797 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLS3P13797 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLS3P13797 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLS3P13797 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLS3P13797 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PLS3P13797 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLS3P13797 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLS3P13797 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLS3P13797 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLS3P13797 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms