Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GP1BBP13224 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GP1BBP13224 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GP1BBP13224 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms