Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLUP10909 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLUP10909 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLUP10909 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CLUP10909 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CLUP10909 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLUP10909 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLUP10909 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLUP10909 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLUP10909 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLUP10909 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLUP10909 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLUP10909 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLUP10909 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLUP10909 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLUP10909 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLUP10909 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CLUP10909 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLUP10909 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLUP10909 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CLUP10909 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLUP10909 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLUP10909 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLUP10909 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLUP10909 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLUP10909 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLUP10909 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLUP10909 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLUP10909 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLUP10909 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLUP10909 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLUP10909 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLUP10909 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLUP10909 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLUP10909 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLUP10909 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLUP10909 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLUP10909 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLUP10909 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLUP10909 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLUP10909 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLUP10909 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLUP10909 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CLUP10909 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLUP10909 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLUP10909 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLUP10909 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLUP10909 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLUP10909 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLUP10909 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLUP10909 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLUP10909 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLUP10909 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLUP10909 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLUP10909 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLUP10909 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLUP10909 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLUP10909 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLUP10909 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLUP10909 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLUP10909 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLUP10909 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLUP10909 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLUP10909 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLUP10909 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLUP10909 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLUP10909 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLUP10909 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLUP10909 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLUP10909 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLUP10909 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLUP10909 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLUP10909 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLUP10909 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLUP10909 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLUP10909 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLUP10909 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLUP10909 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLUP10909 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLUP10909 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CLUP10909 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLUP10909 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLUP10909 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLUP10909 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLUP10909 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLUP10909 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLUP10909 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CLUP10909 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLUP10909 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLUP10909 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLUP10909 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLUP10909 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLUP10909 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLUP10909 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLUP10909 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLUP10909 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLUP10909 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLUP10909 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLUP10909 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLUP10909 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms