Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD7

PGA4, Pepsin A-4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA4P0DJD7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGA4P0DJD7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PGA4P0DJD7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms