Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM13P0DJ93 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms