Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM6P0DI80 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM6P0DI80 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms