Protein–RNA interactions for Protein: P0CG37

CFC1, Cryptic protein, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFC1P0CG37 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFC1P0CG37 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CFC1P0CG37 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CFC1P0CG37 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CFC1P0CG37 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CFC1P0CG37 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CFC1P0CG37 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CFC1P0CG37 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CFC1P0CG37 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFC1P0CG37 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFC1P0CG37 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFC1P0CG37 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFC1P0CG37 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFC1P0CG37 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFC1P0CG37 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFC1P0CG37 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFC1P0CG37 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CFC1P0CG37 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CFC1P0CG37 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms