Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRPRAP08240 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPRAP08240 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms