Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NGFRP08138 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NGFRP08138 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NGFRP08138 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NGFRP08138 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NGFRP08138 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NGFRP08138 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NGFRP08138 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NGFRP08138 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NGFRP08138 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NGFRP08138 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NGFRP08138 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NGFRP08138 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NGFRP08138 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NGFRP08138 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NGFRP08138 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NGFRP08138 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NGFRP08138 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NGFRP08138 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NGFRP08138 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NGFRP08138 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NGFRP08138 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NGFRP08138 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NGFRP08138 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NGFRP08138 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NGFRP08138 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NGFRP08138 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NGFRP08138 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NGFRP08138 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NGFRP08138 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NGFRP08138 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NGFRP08138 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NGFRP08138 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NGFRP08138 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NGFRP08138 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NGFRP08138 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NGFRP08138 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NGFRP08138 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NGFRP08138 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NGFRP08138 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NGFRP08138 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NGFRP08138 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NGFRP08138 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NGFRP08138 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NGFRP08138 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NGFRP08138 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NGFRP08138 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NGFRP08138 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NGFRP08138 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NGFRP08138 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NGFRP08138 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NGFRP08138 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NGFRP08138 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NGFRP08138 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NGFRP08138 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NGFRP08138 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NGFRP08138 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NGFRP08138 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NGFRP08138 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NGFRP08138 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NGFRP08138 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NGFRP08138 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NGFRP08138 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NGFRP08138 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NGFRP08138 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NGFRP08138 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NGFRP08138 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NGFRP08138 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NGFRP08138 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NGFRP08138 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NGFRP08138 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NGFRP08138 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NGFRP08138 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NGFRP08138 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NGFRP08138 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NGFRP08138 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NGFRP08138 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NGFRP08138 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NGFRP08138 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NGFRP08138 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NGFRP08138 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NGFRP08138 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NGFRP08138 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NGFRP08138 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NGFRP08138 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NGFRP08138 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NGFRP08138 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NGFRP08138 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NGFRP08138 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NGFRP08138 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NGFRP08138 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NGFRP08138 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NGFRP08138 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NGFRP08138 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NGFRP08138 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NGFRP08138 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NGFRP08138 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NGFRP08138 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NGFRP08138 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NGFRP08138 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms