Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFAP2AP05549 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFAP2AP05549 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFAP2AP05549 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFAP2AP05549 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFAP2AP05549 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFAP2AP05549 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFAP2AP05549 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFAP2AP05549 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFAP2AP05549 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFAP2AP05549 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFAP2AP05549 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFAP2AP05549 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TFAP2AP05549 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TFAP2AP05549 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAP2AP05549 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAP2AP05549 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAP2AP05549 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAP2AP05549 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAP2AP05549 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAP2AP05549 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TFAP2AP05549 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAP2AP05549 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAP2AP05549 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAP2AP05549 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAP2AP05549 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAP2AP05549 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAP2AP05549 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAP2AP05549 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAP2AP05549 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TFAP2AP05549 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFAP2AP05549 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFAP2AP05549 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFAP2AP05549 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFAP2AP05549 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TFAP2AP05549 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms