Protein–RNA interactions for Protein: P04278

SHBG, Sex hormone-binding globulin, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBGP04278 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHBGP04278 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHBGP04278 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHBGP04278 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHBGP04278 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHBGP04278 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHBGP04278 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHBGP04278 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHBGP04278 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHBGP04278 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHBGP04278 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHBGP04278 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHBGP04278 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHBGP04278 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHBGP04278 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHBGP04278 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHBGP04278 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHBGP04278 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHBGP04278 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SHBGP04278 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHBGP04278 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHBGP04278 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHBGP04278 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHBGP04278 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHBGP04278 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHBGP04278 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHBGP04278 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHBGP04278 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHBGP04278 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHBGP04278 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHBGP04278 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHBGP04278 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHBGP04278 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHBGP04278 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHBGP04278 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHBGP04278 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHBGP04278 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHBGP04278 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHBGP04278 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHBGP04278 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHBGP04278 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHBGP04278 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHBGP04278 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHBGP04278 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHBGP04278 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHBGP04278 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHBGP04278 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHBGP04278 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHBGP04278 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHBGP04278 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHBGP04278 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHBGP04278 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHBGP04278 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHBGP04278 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHBGP04278 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHBGP04278 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHBGP04278 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHBGP04278 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHBGP04278 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHBGP04278 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHBGP04278 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHBGP04278 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHBGP04278 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHBGP04278 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHBGP04278 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHBGP04278 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHBGP04278 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHBGP04278 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHBGP04278 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHBGP04278 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHBGP04278 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHBGP04278 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHBGP04278 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHBGP04278 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHBGP04278 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHBGP04278 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHBGP04278 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHBGP04278 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHBGP04278 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHBGP04278 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHBGP04278 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHBGP04278 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHBGP04278 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHBGP04278 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHBGP04278 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHBGP04278 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHBGP04278 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHBGP04278 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SHBGP04278 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHBGP04278 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SHBGP04278 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHBGP04278 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHBGP04278 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SHBGP04278 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHBGP04278 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHBGP04278 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHBGP04278 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHBGP04278 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SHBGP04278 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHBGP04278 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms