Protein–RNA interactions for Protein: P04264

KRT1, Keratin, type II cytoskeletal 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT1P04264 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT1P04264 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT1P04264 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT1P04264 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT1P04264 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT1P04264 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT1P04264 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT1P04264 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT1P04264 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT1P04264 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT1P04264 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT1P04264 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT1P04264 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT1P04264 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT1P04264 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT1P04264 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT1P04264 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT1P04264 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT1P04264 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT1P04264 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT1P04264 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT1P04264 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT1P04264 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT1P04264 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT1P04264 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT1P04264 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT1P04264 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT1P04264 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT1P04264 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT1P04264 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT1P04264 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT1P04264 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT1P04264 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT1P04264 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT1P04264 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT1P04264 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT1P04264 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT1P04264 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT1P04264 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT1P04264 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT1P04264 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT1P04264 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT1P04264 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT1P04264 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT1P04264 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT1P04264 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT1P04264 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT1P04264 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT1P04264 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT1P04264 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT1P04264 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT1P04264 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT1P04264 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT1P04264 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT1P04264 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT1P04264 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT1P04264 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT1P04264 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT1P04264 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT1P04264 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT1P04264 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT1P04264 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT1P04264 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT1P04264 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT1P04264 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT1P04264 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT1P04264 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT1P04264 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT1P04264 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT1P04264 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT1P04264 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT1P04264 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT1P04264 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT1P04264 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT1P04264 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT1P04264 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT1P04264 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT1P04264 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT1P04264 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT1P04264 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT1P04264 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT1P04264 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT1P04264 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT1P04264 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT1P04264 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT1P04264 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT1P04264 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT1P04264 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT1P04264 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT1P04264 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT1P04264 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT1P04264 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT1P04264 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT1P04264 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT1P04264 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT1P04264 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT1P04264 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT1P04264 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT1P04264 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT1P04264 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms