Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTNP04004 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VTNP04004 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTNP04004 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTNP04004 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTNP04004 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTNP04004 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTNP04004 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTNP04004 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VTNP04004 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTNP04004 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTNP04004 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTNP04004 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTNP04004 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTNP04004 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTNP04004 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTNP04004 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTNP04004 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTNP04004 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTNP04004 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTNP04004 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTNP04004 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VTNP04004 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VTNP04004 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VTNP04004 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTNP04004 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTNP04004 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTNP04004 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTNP04004 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VTNP04004 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTNP04004 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTNP04004 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTNP04004 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTNP04004 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTNP04004 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTNP04004 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTNP04004 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTNP04004 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VTNP04004 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VTNP04004 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VTNP04004 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VTNP04004 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
VTNP04004 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VTNP04004 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VTNP04004 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VTNP04004 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VTNP04004 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VTNP04004 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VTNP04004 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VTNP04004 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VTNP04004 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTNP04004 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTNP04004 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTNP04004 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTNP04004 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTNP04004 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VTNP04004 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTNP04004 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTNP04004 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VTNP04004 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VTNP04004 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VTNP04004 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VTNP04004 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VTNP04004 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VTNP04004 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VTNP04004 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VTNP04004 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTNP04004 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTNP04004 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTNP04004 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTNP04004 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTNP04004 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTNP04004 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VTNP04004 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VTNP04004 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VTNP04004 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VTNP04004 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VTNP04004 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VTNP04004 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VTNP04004 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VTNP04004 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VTNP04004 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VTNP04004 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VTNP04004 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VTNP04004 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VTNP04004 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VTNP04004 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VTNP04004 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VTNP04004 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VTNP04004 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTNP04004 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTNP04004 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTNP04004 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTNP04004 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTNP04004 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VTNP04004 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VTNP04004 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTNP04004 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTNP04004 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VTNP04004 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms