Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGGP02679 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGGP02679 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FGGP02679 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGGP02679 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGGP02679 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGGP02679 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGGP02679 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FGGP02679 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGGP02679 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGGP02679 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FGGP02679 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FGGP02679 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FGGP02679 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FGGP02679 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGGP02679 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGGP02679 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGGP02679 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGGP02679 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGGP02679 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGGP02679 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGGP02679 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGGP02679 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FGGP02679 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FGGP02679 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGGP02679 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGGP02679 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGGP02679 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGGP02679 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGGP02679 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGGP02679 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGGP02679 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGGP02679 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGGP02679 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FGGP02679 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGGP02679 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGGP02679 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGGP02679 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGGP02679 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGGP02679 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGGP02679 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FGGP02679 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGGP02679 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGGP02679 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGGP02679 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGGP02679 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGGP02679 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FGGP02679 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FGGP02679 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGGP02679 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGGP02679 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGGP02679 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGGP02679 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGGP02679 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGGP02679 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGGP02679 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGGP02679 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGGP02679 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGGP02679 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGGP02679 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGGP02679 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGGP02679 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGGP02679 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGGP02679 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGGP02679 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGGP02679 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FGGP02679 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGGP02679 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGGP02679 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGGP02679 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGGP02679 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FGGP02679 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGGP02679 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGGP02679 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FGGP02679 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FGGP02679 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FGGP02679 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FGGP02679 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGGP02679 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGGP02679 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGGP02679 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGGP02679 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGGP02679 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGGP02679 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGGP02679 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGGP02679 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGGP02679 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGGP02679 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGGP02679 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGGP02679 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGGP02679 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGGP02679 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGGP02679 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGGP02679 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGGP02679 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGGP02679 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGGP02679 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGGP02679 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGGP02679 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGGP02679 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms