Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C1RP00736 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1RP00736 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1RP00736 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1RP00736 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C1RP00736 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C1RP00736 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1RP00736 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C1RP00736 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1RP00736 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1RP00736 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1RP00736 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C1RP00736 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C1RP00736 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1RP00736 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1RP00736 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C1RP00736 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1RP00736 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1RP00736 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1RP00736 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1RP00736 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1RP00736 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1RP00736 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1RP00736 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1RP00736 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1RP00736 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1RP00736 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1RP00736 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1RP00736 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1RP00736 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1RP00736 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1RP00736 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1RP00736 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1RP00736 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1RP00736 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1RP00736 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1RP00736 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1RP00736 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1RP00736 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1RP00736 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1RP00736 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1RP00736 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1RP00736 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1RP00736 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1RP00736 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1RP00736 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1RP00736 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1RP00736 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1RP00736 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1RP00736 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1RP00736 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1RP00736 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1RP00736 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1RP00736 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1RP00736 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1RP00736 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1RP00736 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C1RP00736 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1RP00736 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1RP00736 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1RP00736 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1RP00736 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1RP00736 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
C1RP00736 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1RP00736 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
C1RP00736 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1RP00736 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1RP00736 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1RP00736 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1RP00736 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1RP00736 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1RP00736 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1RP00736 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1RP00736 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1RP00736 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1RP00736 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1RP00736 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1RP00736 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1RP00736 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
C1RP00736 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1RP00736 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1RP00736 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1RP00736 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1RP00736 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1RP00736 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1RP00736 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1RP00736 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1RP00736 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1RP00736 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1RP00736 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1RP00736 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1RP00736 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1RP00736 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1RP00736 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1RP00736 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1RP00736 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1RP00736 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1RP00736 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1RP00736 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1RP00736 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms