Protein–RNA interactions for Protein: O96013

PAK4, Serine/threonine-protein kinase PAK 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK4O96013 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAK4O96013 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAK4O96013 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAK4O96013 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAK4O96013 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAK4O96013 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PAK4O96013 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAK4O96013 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAK4O96013 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAK4O96013 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAK4O96013 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAK4O96013 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAK4O96013 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAK4O96013 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAK4O96013 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PAK4O96013 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAK4O96013 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAK4O96013 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAK4O96013 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAK4O96013 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAK4O96013 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAK4O96013 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAK4O96013 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAK4O96013 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PAK4O96013 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAK4O96013 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAK4O96013 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PAK4O96013 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAK4O96013 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAK4O96013 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAK4O96013 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAK4O96013 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAK4O96013 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAK4O96013 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAK4O96013 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PAK4O96013 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAK4O96013 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAK4O96013 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAK4O96013 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAK4O96013 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAK4O96013 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAK4O96013 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAK4O96013 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAK4O96013 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAK4O96013 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAK4O96013 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAK4O96013 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAK4O96013 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAK4O96013 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAK4O96013 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAK4O96013 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAK4O96013 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAK4O96013 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAK4O96013 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAK4O96013 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAK4O96013 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PAK4O96013 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PAK4O96013 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PAK4O96013 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAK4O96013 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAK4O96013 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAK4O96013 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAK4O96013 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAK4O96013 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PAK4O96013 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PAK4O96013 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAK4O96013 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAK4O96013 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAK4O96013 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAK4O96013 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAK4O96013 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAK4O96013 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAK4O96013 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAK4O96013 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAK4O96013 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAK4O96013 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAK4O96013 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAK4O96013 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAK4O96013 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAK4O96013 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAK4O96013 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PAK4O96013 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAK4O96013 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAK4O96013 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAK4O96013 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAK4O96013 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAK4O96013 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAK4O96013 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAK4O96013 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAK4O96013 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAK4O96013 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PAK4O96013 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAK4O96013 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAK4O96013 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PAK4O96013 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAK4O96013 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAK4O96013 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PAK4O96013 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAK4O96013 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PAK4O96013 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms