Protein–RNA interactions for Protein: O95935

TBX18, T-box transcription factor TBX18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX18O95935 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBX18O95935 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBX18O95935 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBX18O95935 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBX18O95935 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBX18O95935 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX18O95935 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX18O95935 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX18O95935 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX18O95935 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX18O95935 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX18O95935 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX18O95935 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX18O95935 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX18O95935 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX18O95935 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX18O95935 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX18O95935 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBX18O95935 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TBX18O95935 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TBX18O95935 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBX18O95935 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBX18O95935 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBX18O95935 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBX18O95935 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX18O95935 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX18O95935 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX18O95935 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX18O95935 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX18O95935 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX18O95935 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX18O95935 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX18O95935 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX18O95935 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX18O95935 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBX18O95935 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TBX18O95935 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TBX18O95935 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TBX18O95935 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TBX18O95935 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TBX18O95935 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TBX18O95935 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBX18O95935 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBX18O95935 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBX18O95935 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBX18O95935 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TBX18O95935 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TBX18O95935 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBX18O95935 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBX18O95935 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBX18O95935 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX18O95935 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX18O95935 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX18O95935 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX18O95935 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX18O95935 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX18O95935 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX18O95935 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX18O95935 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX18O95935 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX18O95935 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX18O95935 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX18O95935 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX18O95935 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX18O95935 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX18O95935 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX18O95935 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX18O95935 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX18O95935 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX18O95935 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX18O95935 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TBX18O95935 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TBX18O95935 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TBX18O95935 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TBX18O95935 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TBX18O95935 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TBX18O95935 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TBX18O95935 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TBX18O95935 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TBX18O95935 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TBX18O95935 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TBX18O95935 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBX18O95935 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TBX18O95935 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBX18O95935 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TBX18O95935 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TBX18O95935 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBX18O95935 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBX18O95935 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TBX18O95935 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TBX18O95935 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TBX18O95935 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TBX18O95935 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TBX18O95935 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TBX18O95935 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TBX18O95935 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TBX18O95935 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TBX18O95935 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TBX18O95935 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TBX18O95935 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms