Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX58O95786 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX58O95786 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX58O95786 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX58O95786 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX58O95786 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX58O95786 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX58O95786 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX58O95786 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX58O95786 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX58O95786 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX58O95786 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX58O95786 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX58O95786 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX58O95786 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX58O95786 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX58O95786 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX58O95786 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX58O95786 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX58O95786 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX58O95786 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX58O95786 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX58O95786 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX58O95786 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX58O95786 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX58O95786 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX58O95786 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX58O95786 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX58O95786 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX58O95786 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX58O95786 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX58O95786 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX58O95786 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX58O95786 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX58O95786 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX58O95786 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX58O95786 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX58O95786 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX58O95786 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
DDX58O95786 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DDX58O95786 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DDX58O95786 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DDX58O95786 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DDX58O95786 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX58O95786 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX58O95786 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX58O95786 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX58O95786 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX58O95786 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX58O95786 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX58O95786 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX58O95786 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX58O95786 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX58O95786 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX58O95786 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX58O95786 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX58O95786 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX58O95786 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX58O95786 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX58O95786 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX58O95786 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX58O95786 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX58O95786 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX58O95786 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX58O95786 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX58O95786 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX58O95786 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX58O95786 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX58O95786 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX58O95786 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX58O95786 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX58O95786 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX58O95786 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX58O95786 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX58O95786 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX58O95786 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX58O95786 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX58O95786 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX58O95786 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX58O95786 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX58O95786 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX58O95786 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX58O95786 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DDX58O95786 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DDX58O95786 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDX58O95786 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDX58O95786 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDX58O95786 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDX58O95786 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDX58O95786 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX58O95786 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX58O95786 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX58O95786 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX58O95786 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX58O95786 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX58O95786 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDX58O95786 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
DDX58O95786 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDX58O95786 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDX58O95786 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms