Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STAMBPO95630 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
STAMBPO95630 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
STAMBPO95630 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms