Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMUO75648 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMUO75648 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRMUO75648 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRMUO75648 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRMUO75648 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRMUO75648 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRMUO75648 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRMUO75648 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRMUO75648 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRMUO75648 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRMUO75648 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRMUO75648 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRMUO75648 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMUO75648 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMUO75648 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMUO75648 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMUO75648 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMUO75648 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMUO75648 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMUO75648 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMUO75648 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMUO75648 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMUO75648 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMUO75648 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMUO75648 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMUO75648 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMUO75648 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMUO75648 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMUO75648 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMUO75648 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMUO75648 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMUO75648 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMUO75648 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMUO75648 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMUO75648 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMUO75648 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMUO75648 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMUO75648 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMUO75648 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMUO75648 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMUO75648 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMUO75648 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMUO75648 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMUO75648 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMUO75648 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMUO75648 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMUO75648 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMUO75648 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMUO75648 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMUO75648 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMUO75648 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMUO75648 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMUO75648 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMUO75648 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMUO75648 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMUO75648 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMUO75648 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMUO75648 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMUO75648 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMUO75648 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMUO75648 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMUO75648 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMUO75648 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMUO75648 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMUO75648 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMUO75648 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMUO75648 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMUO75648 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMUO75648 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMUO75648 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMUO75648 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRMUO75648 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMUO75648 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMUO75648 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMUO75648 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRMUO75648 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRMUO75648 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRMUO75648 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMUO75648 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMUO75648 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMUO75648 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMUO75648 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMUO75648 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMUO75648 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMUO75648 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMUO75648 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMUO75648 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMUO75648 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMUO75648 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMUO75648 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMUO75648 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMUO75648 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMUO75648 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRMUO75648 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMUO75648 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMUO75648 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMUO75648 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMUO75648 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRMUO75648 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms