Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LGR5O75473 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LGR5O75473 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LGR5O75473 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LGR5O75473 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LGR5O75473 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LGR5O75473 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LGR5O75473 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LGR5O75473 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LGR5O75473 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LGR5O75473 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LGR5O75473 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LGR5O75473 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LGR5O75473 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LGR5O75473 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LGR5O75473 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LGR5O75473 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LGR5O75473 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LGR5O75473 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LGR5O75473 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LGR5O75473 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LGR5O75473 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LGR5O75473 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LGR5O75473 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LGR5O75473 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LGR5O75473 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LGR5O75473 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LGR5O75473 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LGR5O75473 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LGR5O75473 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LGR5O75473 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LGR5O75473 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LGR5O75473 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LGR5O75473 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LGR5O75473 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LGR5O75473 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LGR5O75473 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LGR5O75473 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LGR5O75473 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LGR5O75473 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LGR5O75473 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LGR5O75473 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LGR5O75473 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LGR5O75473 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LGR5O75473 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LGR5O75473 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LGR5O75473 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LGR5O75473 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LGR5O75473 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LGR5O75473 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LGR5O75473 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LGR5O75473 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LGR5O75473 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LGR5O75473 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LGR5O75473 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LGR5O75473 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LGR5O75473 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LGR5O75473 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LGR5O75473 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LGR5O75473 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LGR5O75473 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGR5O75473 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGR5O75473 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGR5O75473 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGR5O75473 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGR5O75473 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGR5O75473 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGR5O75473 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGR5O75473 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LGR5O75473 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LGR5O75473 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGR5O75473 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGR5O75473 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGR5O75473 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGR5O75473 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGR5O75473 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR5O75473 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR5O75473 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR5O75473 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR5O75473 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR5O75473 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR5O75473 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR5O75473 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR5O75473 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR5O75473 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR5O75473 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR5O75473 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR5O75473 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR5O75473 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR5O75473 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR5O75473 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGR5O75473 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGR5O75473 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGR5O75473 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGR5O75473 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LGR5O75473 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGR5O75473 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGR5O75473 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGR5O75473 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LGR5O75473 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms