Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP104O60308 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP104O60308 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP104O60308 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP104O60308 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP104O60308 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP104O60308 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP104O60308 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP104O60308 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP104O60308 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CEP104O60308 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEP104O60308 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEP104O60308 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEP104O60308 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEP104O60308 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEP104O60308 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEP104O60308 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEP104O60308 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEP104O60308 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEP104O60308 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEP104O60308 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEP104O60308 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP104O60308 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP104O60308 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP104O60308 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP104O60308 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP104O60308 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP104O60308 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP104O60308 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP104O60308 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP104O60308 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CEP104O60308 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEP104O60308 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEP104O60308 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEP104O60308 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEP104O60308 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEP104O60308 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP104O60308 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP104O60308 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP104O60308 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP104O60308 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP104O60308 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP104O60308 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP104O60308 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP104O60308 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP104O60308 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP104O60308 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP104O60308 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP104O60308 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP104O60308 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP104O60308 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP104O60308 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP104O60308 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP104O60308 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP104O60308 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP104O60308 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP104O60308 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP104O60308 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP104O60308 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP104O60308 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP104O60308 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP104O60308 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP104O60308 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP104O60308 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP104O60308 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP104O60308 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP104O60308 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP104O60308 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP104O60308 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP104O60308 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP104O60308 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP104O60308 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP104O60308 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP104O60308 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP104O60308 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP104O60308 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP104O60308 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP104O60308 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP104O60308 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP104O60308 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP104O60308 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP104O60308 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP104O60308 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP104O60308 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP104O60308 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP104O60308 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP104O60308 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP104O60308 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP104O60308 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP104O60308 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP104O60308 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP104O60308 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP104O60308 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP104O60308 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP104O60308 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP104O60308 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP104O60308 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP104O60308 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP104O60308 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP104O60308 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms