Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP9O43818 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP9O43818 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP9O43818 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP9O43818 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP9O43818 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP9O43818 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP9O43818 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP9O43818 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP9O43818 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP9O43818 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP9O43818 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP9O43818 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP9O43818 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP9O43818 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP9O43818 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP9O43818 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP9O43818 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP9O43818 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP9O43818 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP9O43818 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP9O43818 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP9O43818 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP9O43818 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP9O43818 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP9O43818 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP9O43818 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP9O43818 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP9O43818 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP9O43818 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP9O43818 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP9O43818 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP9O43818 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP9O43818 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP9O43818 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP9O43818 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP9O43818 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP9O43818 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP9O43818 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP9O43818 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP9O43818 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP9O43818 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP9O43818 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP9O43818 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP9O43818 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP9O43818 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP9O43818 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP9O43818 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP9O43818 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP9O43818 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP9O43818 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP9O43818 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP9O43818 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP9O43818 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP9O43818 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP9O43818 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP9O43818 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP9O43818 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP9O43818 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP9O43818 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP9O43818 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP9O43818 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP9O43818 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP9O43818 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP9O43818 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP9O43818 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP9O43818 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP9O43818 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP9O43818 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP9O43818 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP9O43818 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP9O43818 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP9O43818 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP9O43818 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP9O43818 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP9O43818 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP9O43818 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP9O43818 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP9O43818 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP9O43818 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP9O43818 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP9O43818 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP9O43818 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP9O43818 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP9O43818 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RRP9O43818 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RRP9O43818 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RRP9O43818 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RRP9O43818 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP9O43818 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP9O43818 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP9O43818 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP9O43818 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP9O43818 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP9O43818 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP9O43818 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP9O43818 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP9O43818 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP9O43818 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP9O43818 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms