Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KDELR3O43731 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELR3O43731 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms