Protein–RNA interactions for Protein: O43639

NCK2, Cytoplasmic protein NCK2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK2O43639 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NCK2O43639 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NCK2O43639 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NCK2O43639 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NCK2O43639 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCK2O43639 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NCK2O43639 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCK2O43639 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCK2O43639 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCK2O43639 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCK2O43639 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCK2O43639 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCK2O43639 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCK2O43639 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCK2O43639 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCK2O43639 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCK2O43639 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCK2O43639 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCK2O43639 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCK2O43639 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCK2O43639 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCK2O43639 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCK2O43639 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCK2O43639 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCK2O43639 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCK2O43639 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCK2O43639 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCK2O43639 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCK2O43639 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCK2O43639 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCK2O43639 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCK2O43639 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCK2O43639 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCK2O43639 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NCK2O43639 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCK2O43639 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCK2O43639 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCK2O43639 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCK2O43639 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCK2O43639 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCK2O43639 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCK2O43639 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCK2O43639 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCK2O43639 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCK2O43639 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCK2O43639 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCK2O43639 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCK2O43639 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NCK2O43639 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCK2O43639 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCK2O43639 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCK2O43639 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCK2O43639 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCK2O43639 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCK2O43639 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCK2O43639 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCK2O43639 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCK2O43639 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCK2O43639 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCK2O43639 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCK2O43639 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NCK2O43639 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCK2O43639 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCK2O43639 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCK2O43639 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCK2O43639 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCK2O43639 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCK2O43639 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCK2O43639 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCK2O43639 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCK2O43639 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCK2O43639 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCK2O43639 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCK2O43639 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCK2O43639 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCK2O43639 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCK2O43639 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCK2O43639 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCK2O43639 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCK2O43639 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCK2O43639 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCK2O43639 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCK2O43639 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCK2O43639 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCK2O43639 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCK2O43639 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCK2O43639 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCK2O43639 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCK2O43639 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCK2O43639 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NCK2O43639 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NCK2O43639 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCK2O43639 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCK2O43639 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCK2O43639 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCK2O43639 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCK2O43639 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCK2O43639 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCK2O43639 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCK2O43639 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms