Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TIMM44O43615 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMM44O43615 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TIMM44O43615 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms