Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRXO43186 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRXO43186 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRXO43186 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRXO43186 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CRXO43186 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CRXO43186 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CRXO43186 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRXO43186 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRXO43186 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRXO43186 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRXO43186 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRXO43186 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRXO43186 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRXO43186 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CRXO43186 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CRXO43186 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRXO43186 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRXO43186 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRXO43186 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRXO43186 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRXO43186 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRXO43186 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRXO43186 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRXO43186 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRXO43186 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRXO43186 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRXO43186 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRXO43186 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRXO43186 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRXO43186 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRXO43186 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRXO43186 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRXO43186 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRXO43186 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CRXO43186 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRXO43186 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRXO43186 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRXO43186 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRXO43186 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRXO43186 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRXO43186 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRXO43186 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRXO43186 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRXO43186 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRXO43186 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRXO43186 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRXO43186 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRXO43186 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRXO43186 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRXO43186 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRXO43186 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRXO43186 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRXO43186 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRXO43186 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRXO43186 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRXO43186 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRXO43186 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRXO43186 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRXO43186 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CRXO43186 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRXO43186 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRXO43186 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRXO43186 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRXO43186 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRXO43186 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRXO43186 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRXO43186 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRXO43186 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRXO43186 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRXO43186 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRXO43186 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRXO43186 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRXO43186 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRXO43186 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRXO43186 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRXO43186 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CRXO43186 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRXO43186 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRXO43186 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRXO43186 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRXO43186 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRXO43186 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRXO43186 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRXO43186 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRXO43186 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRXO43186 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRXO43186 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRXO43186 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRXO43186 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRXO43186 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRXO43186 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRXO43186 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CRXO43186 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRXO43186 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRXO43186 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRXO43186 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRXO43186 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRXO43186 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRXO43186 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms