Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NDUFS4O43181 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NDUFS4O43181 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDUFS4O43181 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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