Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHGDHO43175 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PHGDHO43175 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHGDHO43175 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms