Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN3O15551 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN3O15551 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN3O15551 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN3O15551 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN3O15551 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN3O15551 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.56
CLDN3O15551 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN3O15551 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms