Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLOCKO15516 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLOCKO15516 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms