Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHADO15335 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHADO15335 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHADO15335 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHADO15335 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHADO15335 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHADO15335 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHADO15335 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHADO15335 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHADO15335 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHADO15335 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHADO15335 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHADO15335 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHADO15335 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHADO15335 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHADO15335 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHADO15335 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHADO15335 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHADO15335 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHADO15335 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHADO15335 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHADO15335 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHADO15335 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHADO15335 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHADO15335 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHADO15335 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHADO15335 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHADO15335 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHADO15335 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHADO15335 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHADO15335 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHADO15335 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHADO15335 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHADO15335 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHADO15335 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHADO15335 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHADO15335 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHADO15335 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHADO15335 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHADO15335 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHADO15335 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHADO15335 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHADO15335 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHADO15335 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHADO15335 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHADO15335 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHADO15335 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHADO15335 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHADO15335 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHADO15335 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHADO15335 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHADO15335 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHADO15335 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHADO15335 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHADO15335 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHADO15335 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHADO15335 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHADO15335 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHADO15335 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHADO15335 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHADO15335 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHADO15335 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHADO15335 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHADO15335 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHADO15335 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CHADO15335 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CHADO15335 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHADO15335 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHADO15335 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CHADO15335 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHADO15335 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHADO15335 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHADO15335 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHADO15335 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHADO15335 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHADO15335 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHADO15335 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHADO15335 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHADO15335 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHADO15335 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHADO15335 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHADO15335 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHADO15335 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHADO15335 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHADO15335 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHADO15335 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHADO15335 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHADO15335 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHADO15335 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHADO15335 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHADO15335 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHADO15335 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHADO15335 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHADO15335 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHADO15335 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHADO15335 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHADO15335 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHADO15335 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHADO15335 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHADO15335 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms