Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM6BO15054 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM6BO15054 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM6BO15054 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM6BO15054 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM6BO15054 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM6BO15054 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM6BO15054 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM6BO15054 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM6BO15054 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM6BO15054 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM6BO15054 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM6BO15054 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM6BO15054 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM6BO15054 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM6BO15054 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM6BO15054 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM6BO15054 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM6BO15054 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
KDM6BO15054 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
KDM6BO15054 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
KDM6BO15054 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
KDM6BO15054 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
KDM6BO15054 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
KDM6BO15054 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms