Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IKBKBO14920 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IKBKBO14920 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms