Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PHOX2AO14813 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHOX2AO14813 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms