Protein–RNA interactions for Protein: O00746

NME4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4O00746 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME4O00746 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NME4O00746 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME4O00746 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NME4O00746 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME4O00746 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME4O00746 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME4O00746 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME4O00746 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME4O00746 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME4O00746 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME4O00746 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME4O00746 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME4O00746 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME4O00746 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NME4O00746 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME4O00746 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME4O00746 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NME4O00746 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME4O00746 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NME4O00746 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME4O00746 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME4O00746 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME4O00746 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME4O00746 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NME4O00746 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME4O00746 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME4O00746 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME4O00746 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME4O00746 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME4O00746 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME4O00746 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NME4O00746 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME4O00746 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME4O00746 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME4O00746 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME4O00746 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME4O00746 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME4O00746 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME4O00746 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME4O00746 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME4O00746 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME4O00746 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME4O00746 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME4O00746 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME4O00746 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME4O00746 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME4O00746 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME4O00746 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME4O00746 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME4O00746 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NME4O00746 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME4O00746 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME4O00746 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME4O00746 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME4O00746 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME4O00746 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME4O00746 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME4O00746 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME4O00746 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NME4O00746 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME4O00746 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME4O00746 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME4O00746 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME4O00746 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME4O00746 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NME4O00746 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME4O00746 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME4O00746 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME4O00746 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME4O00746 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME4O00746 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NME4O00746 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME4O00746 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME4O00746 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME4O00746 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NME4O00746 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME4O00746 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME4O00746 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME4O00746 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME4O00746 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME4O00746 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME4O00746 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME4O00746 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME4O00746 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NME4O00746 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME4O00746 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME4O00746 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME4O00746 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME4O00746 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME4O00746 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NME4O00746 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME4O00746 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME4O00746 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME4O00746 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME4O00746 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME4O00746 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME4O00746 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME4O00746 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME4O00746 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms