Protein–RNA interactions for Protein: O00327

ARNTL, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARNTLO00327 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARNTLO00327 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARNTLO00327 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARNTLO00327 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARNTLO00327 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARNTLO00327 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARNTLO00327 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARNTLO00327 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARNTLO00327 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARNTLO00327 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARNTLO00327 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARNTLO00327 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARNTLO00327 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ARNTLO00327 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARNTLO00327 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARNTLO00327 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARNTLO00327 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARNTLO00327 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARNTLO00327 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARNTLO00327 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARNTLO00327 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARNTLO00327 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARNTLO00327 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARNTLO00327 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARNTLO00327 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARNTLO00327 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARNTLO00327 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARNTLO00327 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARNTLO00327 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARNTLO00327 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARNTLO00327 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARNTLO00327 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARNTLO00327 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARNTLO00327 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms