Protein–RNA interactions for Protein: J3QRE1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRE1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QRE1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QRE1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QRE1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QRE1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QRE1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QRE1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QRE1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QRE1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QRE1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QRE1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QRE1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QRE1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QRE1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QRE1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QRE1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QRE1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QRE1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QRE1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QRE1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QRE1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
J3QRE1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRE1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRE1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRE1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRE1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRE1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRE1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRE1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRE1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRE1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRE1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRE1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRE1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRE1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRE1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRE1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRE1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRE1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QRE1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QRE1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QRE1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QRE1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QRE1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QRE1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QRE1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QRE1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QRE1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QRE1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QRE1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QRE1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QRE1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QRE1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QRE1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QRE1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QRE1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRE1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRE1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRE1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRE1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRE1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRE1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRE1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRE1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRE1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRE1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRE1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRE1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QRE1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QRE1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QRE1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QRE1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QRE1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QRE1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QRE1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QRE1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QRE1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QRE1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QRE1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QRE1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QRE1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QRE1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QRE1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QRE1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QRE1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QRE1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QRE1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QRE1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QRE1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QRE1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QRE1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QRE1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QRE1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QRE1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QRE1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QRE1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QRE1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QRE1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QRE1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
J3QRE1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms