Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.7 ms