Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC188H7C350 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC188H7C350 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms