Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms