Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRAPPC2LH3BP13 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRAPPC2LH3BP13 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms