Protein–RNA interactions for Protein: H3BMG3

SMKR1, Small lysine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1H3BMG3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMKR1H3BMG3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMKR1H3BMG3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms