Protein–RNA interactions for Protein: B3SHH9

TMEM114, Transmembrane protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM114B3SHH9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM114B3SHH9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms