Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NOTOA8MTQ0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NOTOA8MTQ0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms