Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRRM3A6NNA2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRRM3A6NNA2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms