Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A6NL46 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A6NL46 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A6NL46 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A6NL46 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
A6NL46 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A6NL46 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A6NL46 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A6NL46 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A6NL46 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A6NL46 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A6NL46 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A6NL46 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A6NL46 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A6NL46 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A6NL46 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A6NL46 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A6NL46 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A6NL46 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A6NL46 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A6NL46 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A6NL46 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A6NL46 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A6NL46 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A6NL46 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A6NL46 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NL46 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NL46 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NL46 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NL46 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NL46 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NL46 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NL46 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NL46 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NL46 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NL46 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NL46 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A6NL46 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A6NL46 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A6NL46 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A6NL46 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A6NL46 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A6NL46 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A6NL46 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
A6NL46 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A6NL46 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A6NL46 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A6NL46 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A6NL46 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A6NL46 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A6NL46 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A6NL46 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
A6NL46 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
A6NL46 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.32■■□□□ 1
A6NL46 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.32■■□□□ 1
A6NL46 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.32■■□□□ 1
A6NL46 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A6NL46 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A6NL46 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A6NL46 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A6NL46 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A6NL46 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A6NL46 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
A6NL46 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A6NL46 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.3■■□□□ 1
A6NL46 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A6NL46 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A6NL46 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A6NL46 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A6NL46 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A6NL46 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A6NL46 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A6NL46 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A6NL46 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A6NL46 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A6NL46 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A6NL46 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A6NL46 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A6NL46 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.29■■□□□ 1
A6NL46 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A6NL46 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
A6NL46 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
A6NL46 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A6NL46 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.29■■□□□ 1
A6NL46 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.29■■□□□ 1
A6NL46 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A6NL46 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A6NL46 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A6NL46 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A6NL46 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A6NL46 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A6NL46 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A6NL46 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A6NL46 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A6NL46 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
A6NL46 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A6NL46 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A6NL46 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A6NL46 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A6NL46 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms